在细菌、霉菌和植物中次级代谢产物的生物合成常常受到磷酸盐的控制。实际上，在高浓度磷酸盐的培养条件下所有次级代谢产物都将受到抑制，但是对磷酸盐抑制的敏感性却存在很大的差别。不同的产物之间、甚至同一细胞产生的不同次级代谢产物也会有不同的表现。S.clavuligerus发酵生产棒酸或头霉素就是一个典型例子，棒酸的合成受到磷酸盐的抑制，而头霉素的生产则基本上不受影响。因此只要调节磷酸盐的浓度进行培养就可以得到不同的产物。一般而言，如果抗生素的生物合成直接由氨基酸装配而成，它们对磷酸盐浓度的敏感性就比较小，如聚酮类和氨基糖苷类抗生素就是如此。

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